Возможно появление функциональных запоров у младенцев при развитии аллергии к белкам коровьего молока. Такое возможно при наследственной предрасположенности к аллергическим заболеваниям; при кормлении новорожденного в роддоме молочной смесью; при раннем переводе ребенка на искусственное или смешанное вскармливание.

Бывает угнетение или отсутствие выработки рефлекса (условно–рефлек­тор­ные, психогенные запоры). Данный вид запоров не­редко отмечается у стеснительных детей в период адапта­ции к новым условиям (ясли, детский сад, школа). Подав­ле­ние рефлекса на дефекацию приводит к уплотнению каловых масс, травматизации слизистой прямой кишки, развитию реактивного воспаления (проктит, проктосигмоидит), болезненности при дефекации, формированию «боязни горшка».
Запоры отмечаются при неврозах, возникающих у детей первых двух лет жизни в результате нарушений взаимоотношений матери и ребенка. Так, реакция на разлуку с матерью вначале проявляется плачем, двигательной возбудимостью, расстройством сна, отказом от еды, запорами. В дальнейшем дети становятся вялыми, пассивными, восприимчивыми к различным инфекциям. При отсутствии лечения невроз приобретает затяжное течение, а запоры становятся хроническими. Возможно отставание ребенка в физическом и психическом развитии.

Достоверно чаще запоры регистрируются у детей с умственной отсталостью по сравнению с детьми, имеющими высокий или средний интеллект (IQ >70), что объясняется более медленным формированием навыков опрятности и ухода за собой у этих детей.

Выделяют запоры, развивающиеся на фоне длительного приема лекарственных препаратов. Миоре­лак­санты (толперизон, баклофен), противосудорожные препараты (фенитоин, производные вальпроевой кислоты), холинолитики (атропин) вызывают блокаду нервных путей, регулирующих моторику толстой кишки. Диуре­тики (ацетазоламид, фуросемид) приводят к потерям калия и ослаблению сократительной функции гладкой мускулатуры кишечника. Психотропные средства (антидепрессанты, транквилизаторы) вызывают торможение коркового и подкоркового центров дефекации.

Нередко запоры наблюдаются после перенесенной острой дизентерии за счет повреждения интрамуральных ганглиев и на фоне кишечного дисбактериоза в результате уменьшения количества нормальной кишечной флоры, продуцирующей молочную кислоту и стимулирующей моторику кишечника.